Advance Search

STUDI PENAMBATAN MOLEKUL SENYAWA-SENYAWA BIOAKTIF DARI KULIT AKAR MURBEI (Morus sp.) TERHADAP RESEPTOR TNF-α

DOI: https://doi.org/10.20956/mff.v23i3.9399
Article History

Submited : February 16, 2020
Published : February 16, 2020

Tumor necrosis factor alfa (TNF)-α memiliki peranan penting dalam patogenesis beberapa penyakit inflamasi. Murbei dilaporkan memiliki efek penghambatan pada proses inflamasi. Penelitian ini ditujukan untuk mengetahui interaksi antara senyawa-senyawa bioaktif yang terdapat pada murbei terhadap reseptor TNF-α dengan metode simulasi docking molekuler. Docking dilakukan dengan menggunakan program AutoDock 4.2, dengan menambatkan senyawa pada sisi aktif reseptor TNF-α (PDB ID : 3EWJ) secara in silico. Hasil docking menunjukkan bahwa senyawa-senyawa bioaktif dari kulit akar murbei dapat berinteraksi dengan sisi aktif. Interaksi terbaik ditunjukkan oleh senyawa 86 dengan energi bebas ikatan -13,03 12kkal/mol, yang berinteraksi dengan residu asam amino yang penting pada reseptor TNF-α dan memiliki ikatan hidrogen yang sama pada Leu348, Glu406 dan Gly349 dengan menggunakan pembanding (1S, 3R, 6S)-4-oxo-6{4-[2-phenylquinolon-4-yl)methoxy]phenyl}-5-azaspiro [2.4]heptane-1-carboxylic acid sebagai ligan alami.

References

  1. Levine, S.J., Tumor Necrosis Factor Alpha (TNF-α), National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA, Published by Elsevier Ltd, 2017.
  2. Kimura, Y., Okuda, H., Nomura, T., Fukai, T., & Arichi, S. Effects of phenolic constituents from the Mulberry tree on Arachidonate metabolism in Rat platelets. Journal of Natural Products, 1986; 49: 639–644.
  3. Wei, H., Zhu, JJ., Liu, XQ., Feng, WH., Wang, ZM. and Yan, LH, Review Of Bioactive Compounds From Root Barks Of Morus Plants (Sang-Bai-Pi) And Their Pharmacological Effects, Cogent Chemistry 2016; 2: 1212320
  4. Lestari, Tresna, Studi Interaksi Senyawa Turunan 1,3-Dibenzoiltiourea Sebagai Ribonukleotida Reduktase Inhibitor, Jurnal Farmasi Indonesia, 2015; 7(3):163-169
  5. Pebriana, B. R., Romadhon, F. A., Yunianto, A., Rokhman, R. M., Fitriyah, Q. N., Jenie, I. R., et.al. Docking Kurkumin Dan Senyawa Analognya Pada Reseptor Progesteron: Studi Interaksinya Sebagai Selective Progesterone Receptor Modulators (SPRms), Pharmacon, 2008; 9 (1):14-20
  6. Ferwadi, S., Gunawan, R., dan Astuti, W.., Studi Docking Molekular Senyawa Asam Sinamat Dan Derivatnya Sebagai Inhibitor Protein 1j4x Pada Sel Kanker Serviks, Jurnal Kimia Mulawarman, 2017; 14 (2):84-90
  7. Bissantz, C. G., and Folkers, D. Rognan, Protein-based Virtual Screening of Chemical Databases : Evaluation of Different Docking/Scoring Combinations. Journal of Medicinal Chemistry, 2000; 43:4759-4767.
  8. Pratama, F., R., Moh. 2016, Studi Docking Molekular Senyawa Turunan Kuinolin Terhadap Reseptor Estrogen-α, Jurnal Surya Medika, 2 (1):1-7.
  9. Pranowo, H. D., Kimia Komputasi, Pusat Kimia Komputasi Indonesia Austria, Jurusan Kimia FMIPA, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta; 2006
  10. Paul, J. Gane., and Philip, M. Dean., Recent Advances In Structure-Based Rational Drug Design, Current Opinion in Structural Biology, 2000; 10:401-404
Aswad, M., Christine, L., Nursamsiar, N., & Hardianti, B. (2020). STUDI PENAMBATAN MOLEKUL SENYAWA-SENYAWA BIOAKTIF DARI KULIT AKAR MURBEI (Morus sp.) TERHADAP RESEPTOR TNF-α. Majalah Farmasi Dan Farmakologi, 23(3), 85-100. https://doi.org/10.20956/mff.v23i3.9399

Downloads

Download data is not yet available.
Fulltext
PDF